205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1093 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1093  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 449 aa  869    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.672028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4380  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.658401  normal  0.278802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8634  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00926196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.82 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  23.82 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  21.16 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 		 519 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  26.07 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  21.31 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  21.31 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  21.31 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5722  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102537  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4583  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  28.95 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  27.22 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  24.42 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.52 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.49 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.34 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  21.99 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.41 
 
 		 476 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.07 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.07 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.07 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.48 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  23.12 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.87 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  22.7 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  22.88 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  25.48 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  29.89 
 
 		 579 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  34.23 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0162  major facilitator transporter  25 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>