205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0358 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
423 aa  807    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  51.76 
 
 
420 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
440 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
420 aa  347  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 
423 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
427 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 
399 aa  293  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  31.99 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  34.59 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  30.59 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  28.43 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  38.06 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  23.46 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  30.53 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  25.59 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  32 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  31.85 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  28.17 
 
 
420 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  34.33 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.13 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0694  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.794303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  36.97 
 
 
421 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
390 aa  61.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.11 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  31.37 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
394 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  30.73 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.74 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  28.31 
 
 
458 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.37 
 
 
383 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  32.87 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  35.66 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
463 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  25.23 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  27.8 
 
 
403 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
434 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.25 
 
 
403 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  24.77 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25.23 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25.23 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25.23 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25.23 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  24 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  24.3 
 
 
403 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
411 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  23.83 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  24.85 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  23.83 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  26.17 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  38.82 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.02 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  35.58 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  27.04 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.64 
 
 
525 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.43 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  24.66 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  24.66 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  24.66 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  28.95 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  28.87 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 
478 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 
478 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.95 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  29.37 
 
 
683 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.94 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
483 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.36 
 
 
395 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>