64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2488 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 395 aa  761    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  99.24 
 
 		 395 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  78.91 
 
 		 414 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  72.41 
 
 		 401 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  71.61 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  64.63 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  75.95 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  65.09 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  54.71 
 
 		 401 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 450 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.07 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  24.11 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  23.7 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 418 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25.08 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.26 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.43 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.32 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.75 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5568  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  25.39 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  22.42 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  30.21 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 481 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  31.08 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3963  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>