78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4736 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  774    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  64.63 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  64.63 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  65.19 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  67.35 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  62.04 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  64.69 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  64.27 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  51.3 
 
 		 401 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.6 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 438 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  25.81 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.03 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  31.72 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  31.72 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  27.32 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  24.71 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.06 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.67 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.31 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.22 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  29.41 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  29.41 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  26.67 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  29.41 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  29.41 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  29.41 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  22.75 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>