54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2071 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
368 aa  709    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  75.95 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  75.14 
 
 
395 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  68.63 
 
 
401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  73.94 
 
 
414 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  64.69 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  69.81 
 
 
403 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  65.98 
 
 
387 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  54.89 
 
 
401 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  35.5 
 
 
381 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  33.33 
 
 
450 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  30.33 
 
 
396 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  26.91 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  29.72 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.63 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  27.61 
 
 
407 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
406 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.15 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.2 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
394 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
461 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  31.29 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  25.08 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  30.65 
 
 
453 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  29.05 
 
 
429 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  25.65 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  24.82 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  26.68 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.71 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.78 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.78 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.78 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.23 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  28.38 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.47 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
445 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.47 
 
 
390 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.47 
 
 
390 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.78 
 
 
390 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  27.03 
 
 
430 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  28.57 
 
 
443 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  27.03 
 
 
430 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  21.67 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
415 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  24.24 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>