47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3076 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  781    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  72.41 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  72.41 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  70.03 
 
 		 403 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  71.09 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  65.19 
 
 		 393 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  68.63 
 
 		 368 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  57.14 
 
 		 401 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.79 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.95 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.49 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  24.09 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  40.54 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.75 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  20.93 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 459 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>