90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0816 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  90 
 
 		 396 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  895    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  34.34 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  34.15 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 393 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  34.73 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  32.85 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  25.43 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.47 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 381 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3333  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 568 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.901115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 394 aa  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  24.6 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.1 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  22.37 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.19 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.19 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.19 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 		 485 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.26 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.06 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 504 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.43 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  29.75 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  21.9 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  25.69 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.05 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  29.45 
 
 		 685 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.73 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.01 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  21.9 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  28.33 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  21.61 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  25.69 
 
 		 461 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  28.02 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  28.48 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  35.8 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  33.33 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  21.39 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  29.85 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 519 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.26 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.62 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.62 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  21.61 
 
 		 384 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>