83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3333 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3333  major facilitator transporter  100 
 
 		 568 aa  1134    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.901115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2962  major facilitator superfamily transporter  34.73 
 
 		 980 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2408  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 856 aa  220  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0035  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 808 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0511713  decreased coverage  0.0019821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2524  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  24.61 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  23.94 
 
 		 399 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.98 
 
 		 390 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  33.64 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.98 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 414 aa  51.6  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  23.57 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.67 
 
 		 384 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.98 
 
 		 390 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.67 
 
 		 384 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 384 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 404 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 450 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 521 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.98 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.98 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.98 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.17 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 400 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 400 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 409 aa  47.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 401 aa  47.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  30.84 
 
 		 462 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 460 aa  47.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 430 aa  47  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.29 
 
 		 521 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 400 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  23.04 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3121  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 174 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083055  hitchhiker  0.000923816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2921  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 485 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  23.94 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 374 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 393 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 317 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  21.72 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.96 
 
 		 402 aa  45.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  23.05 
 
 		 440 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  23.97 
 
 		 398 aa  44.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  23.59 
 
 		 400 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 398 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.72 
 
 		 531 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 466 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 432 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  23.17 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 424 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 452 aa  43.9  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  22.76 
 
 		 391 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  22.76 
 
 		 391 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 407 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 478 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.47 
 
 		 407 aa  43.9  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  22.76 
 
 		 391 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  25.82 
 
 		 419 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 429 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>