73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2962 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2962  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 980 aa  1922    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2408  major facilitator superfamily MFS_1  66.18 
 
 		 856 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3333  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.901115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0035  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 808 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0511713  decreased coverage  0.0019821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2524  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 661 aa  97.8  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 243 aa  54.3  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  35.92 
 
 		 434 aa  54.3  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  25.11 
 
 		 685 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 		 493 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  27.86 
 
 		 462 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 404 aa  52  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 500 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.65 
 
 		 500 aa  51.6  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.66 
 
 		 540 aa  51.2  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2519  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.46 
 
 		 452 aa  51.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  30.14 
 
 		 473 aa  50.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 403 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 419 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 509 aa  49.3  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.4 
 
 		 504 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 407 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 403 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.47 
 
 		 403 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 403 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 385 aa  48.9  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.87 
 
 		 502 aa  48.9  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.27 
 
 		 537 aa  48.5  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 424 aa  48.5  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.47 
 
 		 395 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 498 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.85 
 
 		 424 aa  47.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 521 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 518 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 464 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  22.27 
 
 		 420 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.81 
 
 		 411 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 457 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 455 aa  46.2  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  24.75 
 
 		 407 aa  46.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 395 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 395 aa  45.8  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 493 aa  45.8  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 444 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 450 aa  45.8  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 384 aa  45.8  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 464 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.23 
 
 		 512 aa  45.8  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.04 
 
 		 403 aa  45.8  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 		 501 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.16 
 
 		 413 aa  45.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 482 aa  45.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 464 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  28.29 
 
 		 410 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  28.29 
 
 		 410 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 403 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 411 aa  45.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4849  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 563 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  28.29 
 
 		 445 aa  45.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 423 aa  45.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 477 aa  45.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 395 aa  45.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 455 aa  45.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 540 aa  45.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 391 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.34 
 
 		 504 aa  44.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 493 aa  44.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 562 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 517 aa  44.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  24.31 
 
 		 407 aa  44.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 503 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 575 aa  44.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.29 
 
 		 607 aa  44.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 493 aa  44.3  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>