More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0106 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  837    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  837    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.93 
 
 
406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  27.2 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  28.57 
 
 
404 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.82 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  28.14 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
406 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  27.06 
 
 
411 aa  139  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
395 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.68 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
423 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 
403 aa  133  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.99 
 
 
418 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  26.05 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.13 
 
 
416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25.19 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 
410 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  27.39 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.18 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.01 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
413 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.75 
 
 
406 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
397 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  28.29 
 
 
405 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
407 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  28.39 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  28.39 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  28.39 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  28.39 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  28.39 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
397 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  28.53 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.61 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  29.63 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  28.69 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.25 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  28.69 
 
 
404 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.42 
 
 
412 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
403 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
403 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  28.2 
 
 
408 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
408 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  28.2 
 
 
408 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  28.2 
 
 
408 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  28.2 
 
 
408 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  28.2 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  28.02 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
415 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  25.85 
 
 
394 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  35.48 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  25.59 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  28.12 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  22.19 
 
 
407 aa  106  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
406 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
400 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  26.9 
 
 
395 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  30.91 
 
 
405 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0587  major facilitator transporter  26.15 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  28.2 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  27.94 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  27.94 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  27.94 
 
 
404 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  27.94 
 
 
404 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.5 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.78 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  25.75 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  29.05 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.07 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.86 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  23.46 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  26.8 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  31.53 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  26.5 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  30.06 
 
 
444 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.68 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.81 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.81 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.29 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  28.93 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>