219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2524 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2524  major facilitator transporter  100 
 
 		 661 aa  1238    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2962  major facilitator superfamily transporter  26.36 
 
 		 980 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3333  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 568 aa  91.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.901115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2408  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 856 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0035  major facilitator transporter  18.25 
 
 		 808 aa  71.6  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0511713  decreased coverage  0.0019821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.17 
 
 		 420 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.19 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.43 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  28.14 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 607 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 464 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 410 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 433 aa  55.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 409 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.63 
 
 		 401 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 464 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  25 
 
 		 465 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 408 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.9 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 462 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 461 aa  52.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 392 aa  52.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 392 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 413 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  24.81 
 
 		 492 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 398 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 406 aa  50.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  29.85 
 
 		 387 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  24.89 
 
 		 393 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  24.14 
 
 		 455 aa  50.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 444 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.16 
 
 		 418 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  27.49 
 
 		 404 aa  50.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 414 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.68 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 424 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  25.37 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  23.79 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 399 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.03 
 
 		 399 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 399 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  26.34 
 
 		 397 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  29.55 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 454 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.43 
 
 		 418 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 393 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 393 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.4 
 
 		 505 aa  48.9  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  25 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 396 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  26.48 
 
 		 434 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 408 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  21.2 
 
 		 393 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  27.44 
 
 		 405 aa  48.5  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  26.02 
 
 		 396 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.14 
 
 		 546 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 		 609 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 405 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.06 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  20.83 
 
 		 393 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 464 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.11 
 
 		 397 aa  48.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  25.51 
 
 		 396 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 408 aa  48.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  24.64 
 
 		 399 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.34 
 
 		 429 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 511 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 430 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 384 aa  47.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 444 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  29.95 
 
 		 440 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 415 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  28.5 
 
 		 422 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 408 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  30.36 
 
 		 400 aa  47.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  26.95 
 
 		 388 aa  47.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  20.57 
 
 		 393 aa  47.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 485 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 395 aa  47.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 399 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 489 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 421 aa  47.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 407 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 511 aa  47.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  29.46 
 
 		 396 aa  47.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>