More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1316 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  758    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.67 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.67 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.67 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.67 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.78 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 726 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1185  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.224199  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.21 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.96 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.96 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.1 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.26 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 469 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  27.32 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  21.45 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.66 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  21.89 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  25.93 
 
 		 434 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  21.94 
 
 		 506 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 417 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  21.21 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  21.32 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  21.2 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.17 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  21.07 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  21.36 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  23.41 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  20.84 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  21.85 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  21.17 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  22.83 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  22.92 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  23.1 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  23.77 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  19.45 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  20.88 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  23.76 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  23.76 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  23.2 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>