259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1463 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
419 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  84.73 
 
 
420 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  87.17 
 
 
421 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  87.32 
 
 
420 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  77.43 
 
 
418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  77.43 
 
 
418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  77.43 
 
 
418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  64.52 
 
 
422 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  64.25 
 
 
422 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  65.91 
 
 
419 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  50.84 
 
 
425 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  53.19 
 
 
426 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  53.46 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
413 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  35.81 
 
 
412 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
411 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
415 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
415 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
395 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  35.27 
 
 
415 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
477 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  29.68 
 
 
401 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  30 
 
 
401 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  28.47 
 
 
401 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4504  hypothetical protein  63.78 
 
 
158 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  29.07 
 
 
402 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  29.07 
 
 
402 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  29.07 
 
 
402 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  29.07 
 
 
402 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  28.82 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  29.34 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  29.34 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  29.34 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
402 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
402 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  28.98 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  28.98 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  26.65 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  28.86 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  27.57 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  26.38 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  30.97 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  26.12 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  26.12 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  25.87 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  25.43 
 
 
395 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.62 
 
 
393 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.62 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  31.49 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  25.31 
 
 
393 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  25.62 
 
 
397 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  27.81 
 
 
401 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  23.67 
 
 
393 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  32.51 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.65 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.98 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.98 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.86 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.52 
 
 
424 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.61 
 
 
424 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.81 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.1 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.55 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  24.56 
 
 
403 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.36 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.68 
 
 
432 aa  59.7  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  23.41 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.07 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
454 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  25.58 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  26.22 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  26.95 
 
 
409 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  31.74 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  25.78 
 
 
455 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.23 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.29 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.08 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  25.78 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  24.27 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  19.6 
 
 
530 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.838735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.84 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.05 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  28.95 
 
 
442 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.84 
 
 
404 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>