275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2309 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  98.59 
 
 		 426 aa  818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  829    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  53.5 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  53.74 
 
 		 422 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  53.98 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  53.44 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  52.48 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  54.63 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 420 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  54.71 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  35 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 477 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  30.67 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  30.99 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  30.99 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  30.67 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  30.99 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  30.67 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  30.67 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  30.35 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  30.67 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  30.21 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  29.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  29.71 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  29.71 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  28.83 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  28.83 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  30.79 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  27.56 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  28.3 
 
 		 398 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.8 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.53 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.53 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.98 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.19 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.98 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.06 
 
 		 393 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.86 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  30.03 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.67 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.3 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.75 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.86 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.17 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  20.6 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4504  hypothetical protein  36.52 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  25.88 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.34 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  25.49 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  25.1 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.34 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.55 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.71 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  27.94 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  27.57 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  28.25 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.33 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.45 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>