215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10866 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  100 
 
 		 419 aa  816    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  70.11 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  70.11 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  66.67 
 
 		 420 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  70.11 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  65.91 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  67.68 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  65.15 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  62.81 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  63.14 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  56.23 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  55.59 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 412 aa  225  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 477 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  26.37 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4504  hypothetical protein  59.68 
 
 		 158 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  27.86 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  27.6 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  26.52 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  26.52 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  26.52 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.37 
 
 		 399 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  28.62 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  28.28 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  26.17 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  28.28 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  28.28 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  28.28 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.87 
 
 		 393 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.43 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.37 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  23.92 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.18 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.18 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.11 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.62 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  24.8 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  27.17 
 
 		 401 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  25.85 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  25.75 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.8 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.8 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  20.33 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  27.37 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.84 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  28.12 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.84 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  26.75 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  32.85 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  26.67 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  32.26 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.31 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.07 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  28.08 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.36 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>