275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4237 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  97.87 
 
 		 422 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  63.48 
 
 		 420 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  64.25 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  64.25 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  63.44 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  64.18 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  64.18 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  64.18 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  62.69 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  53.74 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  53.74 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  51.31 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  28.46 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  28.07 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  27.05 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  27.46 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  27.53 
 
 		 393 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.46 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  27.15 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.46 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  28.37 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  27.39 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  27.39 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  27.39 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  27.82 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  26.63 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  26.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  26.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  26.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  25.99 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  25.99 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  26.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  26.84 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  26.33 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  25.73 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  23.87 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  27.32 
 
 		 401 aa  118  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  25.8 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  26.37 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4504  hypothetical protein  53.54 
 
 		 158 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  27.76 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.24 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.24 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.77 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.77 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.87 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.87 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  28.81 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  32.59 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 517 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.26 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  22.45 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>