More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3725 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4922  multidrug resistance protein MdtM  85.43 
 
 		 413 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.353329  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  93.6 
 
 		 410 aa  762    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  93.6 
 
 		 410 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  94.35 
 
 		 410 aa  769    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4774  multidrug resistance protein MdtM  85.43 
 
 		 413 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.158436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  803    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  94.35 
 
 		 410 aa  769    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  94.1 
 
 		 410 aa  766    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  93.86 
 
 		 410 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4872  multidrug resistance protein MdtM  85.43 
 
 		 413 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.891982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4848  multidrug resistance protein MdtM  85.43 
 
 		 413 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  93.86 
 
 		 410 aa  764    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4920  multidrug resistance protein MdtM  85.43 
 
 		 413 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  93.6 
 
 		 410 aa  762    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  42.29 
 
 		 409 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 409 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 415 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  40.25 
 
 		 410 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  41.53 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  39.75 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  39.75 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  39.75 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  39.75 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  39.75 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0999  multidrug resistance protein MdtM  41.01 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0938  multidrug resistance protein MdtM  41.01 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1018  multidrug resistance protein MdtM  41.01 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283578  normal  0.445773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0902  multidrug resistance protein MdtM  41.01 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0970  multidrug resistance protein MdtM  41.01 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  34.81 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  34.81 
 
 		 426 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  27.76 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.85 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.83 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.25 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  22.38 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.5 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.06 
 
 		 386 aa  106  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.04 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.51 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.29 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.58 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.76 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  26.07 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  27.18 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.14 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  27.18 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.45 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.45 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.37 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.73 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.27 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.71 
 
 		 430 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.09 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.86 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.56 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.4 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  29.39 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.92 
 
 		 402 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.46 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  22.22 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.99 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  28.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.17 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  28.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  28.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  28.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.77 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.02 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.17 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.6 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  28.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  28.25 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.25 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  28.19 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  26.85 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.26 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  28.25 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  28.38 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2460  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  27.88 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.9 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>