More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0048 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  99.51 
 
 		 409 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  80.64 
 
 		 415 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  99.48 
 
 		 386 aa  761    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  71.39 
 
 		 410 aa  587  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  71.39 
 
 		 410 aa  587  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  71.39 
 
 		 410 aa  587  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  71.39 
 
 		 410 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  71.39 
 
 		 410 aa  587  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  71.39 
 
 		 410 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  70.9 
 
 		 410 aa  584  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  71.64 
 
 		 410 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  72.14 
 
 		 411 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0970  multidrug resistance protein MdtM  71.72 
 
 		 410 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0938  multidrug resistance protein MdtM  71.72 
 
 		 410 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0902  multidrug resistance protein MdtM  71.72 
 
 		 410 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0999  multidrug resistance protein MdtM  71.72 
 
 		 410 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1018  multidrug resistance protein MdtM  71.72 
 
 		 410 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283578  normal  0.445773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  42.67 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  42.67 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  42.67 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  42.67 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  42.97 
 
 		 410 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  42.4 
 
 		 410 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  42.4 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 408 aa  322  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4920  multidrug resistance protein MdtM  40.61 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4872  multidrug resistance protein MdtM  40.61 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.891982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4922  multidrug resistance protein MdtM  40.61 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.353329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4774  multidrug resistance protein MdtM  40.61 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.158436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4848  multidrug resistance protein MdtM  40.61 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 414 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 413 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  43.3 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  43.56 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 405 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.15 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.15 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.5 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30.39 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.06 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.08 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.97 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.41 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.4 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  28.05 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.97 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.67 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  27.44 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.98 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  27.44 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  27.44 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.7 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.51 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  29.26 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.72 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.09 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  28.52 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.99 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  28.52 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.91 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.21 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  25.44 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.18 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.57 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.63 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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