More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5204 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  100 
 
 
388 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  31.96 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  31.7 
 
 
392 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  33.6 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  31.3 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  31.96 
 
 
392 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  32.46 
 
 
410 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  31.7 
 
 
392 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  32.03 
 
 
402 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  33.17 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  33.17 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
416 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  32.92 
 
 
416 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  33.17 
 
 
419 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  33.17 
 
 
419 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  34.24 
 
 
393 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
413 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  32.92 
 
 
419 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  32.92 
 
 
416 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  33.6 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  33.78 
 
 
400 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  32.22 
 
 
410 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 
395 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  31.84 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  32.81 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  31.73 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  31.73 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  31.73 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  31.84 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  31.84 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  31.59 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  30.89 
 
 
409 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  31.38 
 
 
404 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
383 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  29.21 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  31.43 
 
 
403 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  31.95 
 
 
405 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  31.25 
 
 
403 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 
407 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  28.64 
 
 
410 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 
399 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  29.69 
 
 
411 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  30.67 
 
 
399 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  30.19 
 
 
399 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  31.16 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  29.49 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  31.22 
 
 
392 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  31.5 
 
 
405 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  30.51 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  30.81 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  30.51 
 
 
392 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  30.51 
 
 
392 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  30.51 
 
 
392 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  30.26 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  30.26 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  31.44 
 
 
408 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  29.23 
 
 
388 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 
402 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  29.12 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
401 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  28.9 
 
 
409 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  28.2 
 
 
395 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
397 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 
403 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
397 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.41 
 
 
409 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  27.96 
 
 
397 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
391 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
400 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
400 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.58 
 
 
400 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.58 
 
 
400 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
399 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.29 
 
 
447 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.58 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.87 
 
 
505 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.86 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.29 
 
 
506 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  25.58 
 
 
506 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.59 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>