197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6224 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 383 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  52.82 
 
 		 413 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  32.69 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  32.41 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  32.41 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  32.39 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  32.13 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  28.37 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  27.3 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  30.17 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  28.33 
 
 		 410 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  31.09 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  33.06 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  33.06 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  32.78 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  32.78 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  32.07 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  29.05 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  32.78 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  29.03 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  30.86 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  29.11 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  29.8 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  29.97 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  28.61 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  30.27 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  30.27 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  29.5 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  30.24 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  28.77 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  27.95 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  28.44 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  30.32 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  30.16 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  29.97 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  29.97 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  29.97 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  29.84 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  29.67 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  29.84 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  29.8 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 419 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  30.92 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  31.1 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  30.88 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  29.62 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  27.55 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  29.24 
 
 		 403 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  29.68 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  27.98 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  27.08 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  27.08 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  26.79 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.59 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  29.13 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.41 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  21.41 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  21.41 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21.1 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  21.41 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  26.92 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.1 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>