183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0539 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  794    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  30.79 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  32.44 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  31 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  31.41 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  28.72 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  28.72 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  31.96 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  29.68 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  30.95 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  28.2 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  28.8 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  30.95 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  30.95 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  30.95 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  30.42 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  30.42 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  28.43 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  28.43 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  30.47 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  29.95 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  27.79 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  29.97 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  27.32 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  27.32 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  29.77 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  27.53 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  27.53 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  27.69 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  27.53 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  29.57 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  28.89 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  27.72 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  26.86 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  28.86 
 
 		 398 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  27.79 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  29.05 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  30.56 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  27.88 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  27.72 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  26.33 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  26.08 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.99 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.79 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.82 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.04 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.24 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.51 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.04 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>