168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1718 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
410 aa  795    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  43.42 
 
 
392 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  42.93 
 
 
402 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  42.13 
 
 
392 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  42.13 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  42.13 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  42.13 
 
 
392 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  42.56 
 
 
399 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  42.96 
 
 
392 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  42.96 
 
 
392 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  42.82 
 
 
411 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  42.06 
 
 
395 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
392 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  42.71 
 
 
392 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  42.71 
 
 
392 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  42.71 
 
 
392 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  42.82 
 
 
402 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  38.36 
 
 
410 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  42.46 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  42.71 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  38.89 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  42.09 
 
 
399 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  40.1 
 
 
409 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  41.85 
 
 
405 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  39.07 
 
 
419 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 
403 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  39.33 
 
 
419 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
416 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  39.07 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  39.07 
 
 
419 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  39.07 
 
 
416 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  39.07 
 
 
416 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  40.59 
 
 
403 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  41.8 
 
 
400 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  38.82 
 
 
419 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  41.8 
 
 
400 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  41.29 
 
 
404 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  41.16 
 
 
404 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  41.16 
 
 
404 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  41.16 
 
 
404 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  39.3 
 
 
408 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  40.1 
 
 
405 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  40.8 
 
 
404 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
405 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  40.1 
 
 
405 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  40.8 
 
 
404 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  43.05 
 
 
399 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  38.36 
 
 
395 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  39.84 
 
 
409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  42.06 
 
 
395 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  39.51 
 
 
410 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  40.92 
 
 
404 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  40.62 
 
 
407 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  41.37 
 
 
403 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
407 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
407 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
407 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
407 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
407 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 
407 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  38.63 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  40.73 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  41.58 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  38.9 
 
 
400 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  39.52 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  36.46 
 
 
405 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 
402 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  39.23 
 
 
397 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  40.22 
 
 
397 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  40.77 
 
 
397 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  40.5 
 
 
397 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  38.07 
 
 
416 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
410 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  39.37 
 
 
388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  36.39 
 
 
388 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  36.91 
 
 
390 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  32.39 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  40.43 
 
 
225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  39.66 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
383 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.07 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.49 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  26.3 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  26.56 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.3 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.3 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.3 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.19 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.78 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.23 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.87 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.89 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>