130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1513 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  100 
 
 
390 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  44.72 
 
 
403 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  45.28 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  44.41 
 
 
404 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  43.6 
 
 
404 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  43.6 
 
 
404 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  43.6 
 
 
404 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  43.34 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  41.42 
 
 
399 aa  266  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  42.94 
 
 
408 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  43.34 
 
 
404 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  45.25 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  40.41 
 
 
419 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  40.66 
 
 
419 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  40.41 
 
 
419 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  40.41 
 
 
405 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
416 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  40.41 
 
 
405 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  40.41 
 
 
419 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  41.16 
 
 
402 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  41.37 
 
 
400 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  40.15 
 
 
416 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  40.15 
 
 
416 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 
407 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  39.74 
 
 
405 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  39.39 
 
 
409 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  45.25 
 
 
403 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  42.74 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  43.02 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  44.35 
 
 
404 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  41.57 
 
 
411 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  41.13 
 
 
399 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  41.94 
 
 
399 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  41.29 
 
 
395 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 
405 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  39.74 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  39.74 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  42.98 
 
 
399 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  36.29 
 
 
410 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  36.65 
 
 
409 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  40.46 
 
 
400 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  42.05 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  40.67 
 
 
395 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  40.46 
 
 
400 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 
405 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  40.59 
 
 
395 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  35.64 
 
 
407 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  38.99 
 
 
416 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  36.91 
 
 
410 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  41.6 
 
 
392 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  39.06 
 
 
392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  39.06 
 
 
392 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  40.66 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  38.78 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  38.78 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  40.66 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  40.11 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  40.11 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  38.66 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  40.38 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  39.66 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
392 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  39.84 
 
 
392 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  39.84 
 
 
392 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  39.18 
 
 
397 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  38.92 
 
 
397 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  36.07 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  35.56 
 
 
410 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  35.65 
 
 
388 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
410 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  34.27 
 
 
398 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 
393 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  36.22 
 
 
225 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  27.41 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  37.24 
 
 
182 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.22 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.07 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  26.04 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  25.26 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.09 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  25.26 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
399 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
415 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.93 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  23.63 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  26.17 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  30.4 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>