129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0710 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  87.84 
 
 		 407 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  87.84 
 
 		 407 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  97.28 
 
 		 404 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  88.12 
 
 		 404 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  97.28 
 
 		 404 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 404 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  97.28 
 
 		 404 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  87.84 
 
 		 407 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  87.84 
 
 		 407 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  87.84 
 
 		 407 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  87.84 
 
 		 407 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  93.56 
 
 		 404 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  97.28 
 
 		 404 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  99.75 
 
 		 404 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  81.59 
 
 		 403 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  80.89 
 
 		 403 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  79.95 
 
 		 403 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  61.58 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  61.71 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  61.07 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  59.5 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  61.32 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  60.66 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  54.31 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  51.55 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  50.91 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 411 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  50 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 419 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  50.51 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  50.51 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 416 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  51.26 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  51.01 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  50.89 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  50.37 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  50.37 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  50.12 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  52.02 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  49.37 
 
 		 416 aa  334  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  49.49 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  50.37 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  51.79 
 
 		 405 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  49.62 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  46.05 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  44.78 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  45.2 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  44.95 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  44.95 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  44.95 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  39.69 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  40.78 
 
 		 410 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  39.35 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  38.4 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  35.23 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 182 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 225 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.27 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.77 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.04 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.22 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.16 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 455 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  21.93 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>