173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2964 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
410 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  39.41 
 
 
392 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  39.11 
 
 
392 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  39.11 
 
 
392 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  40.99 
 
 
403 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  38.86 
 
 
392 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  38.86 
 
 
392 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  40.73 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  40.77 
 
 
392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  40.77 
 
 
392 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  40.77 
 
 
392 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  40.77 
 
 
392 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  40.51 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  40.51 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  40.26 
 
 
392 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 
402 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  37.47 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  41.4 
 
 
403 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  39.2 
 
 
407 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  37.89 
 
 
402 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  39.16 
 
 
404 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  40.16 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  38.9 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  39.17 
 
 
399 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  39.32 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  39.32 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  39.32 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  38.61 
 
 
400 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  37.86 
 
 
404 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  37.89 
 
 
411 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  37.34 
 
 
395 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  38.14 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  39.77 
 
 
388 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  38.11 
 
 
399 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  36.31 
 
 
410 aa  235  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  37.6 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  38.11 
 
 
404 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  36.32 
 
 
400 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  39.34 
 
 
405 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  36.2 
 
 
400 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  34.11 
 
 
410 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  38.84 
 
 
405 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  38.84 
 
 
405 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  35.1 
 
 
407 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  38.84 
 
 
405 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  38.38 
 
 
405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  36.31 
 
 
388 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  37.15 
 
 
409 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  37.19 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  37.19 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 
419 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 
419 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  37.81 
 
 
419 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 
416 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  35.64 
 
 
416 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  37.3 
 
 
402 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  39.72 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  39 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  38.83 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  36.24 
 
 
397 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  35.98 
 
 
397 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  33.79 
 
 
409 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  36.89 
 
 
397 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  35.19 
 
 
397 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  35.47 
 
 
393 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  34.32 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  35.01 
 
 
395 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  30.23 
 
 
390 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
413 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
391 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  28.21 
 
 
388 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
401 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  32.16 
 
 
225 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.83 
 
 
381 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
383 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.24 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  37.14 
 
 
182 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.32 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.32 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.39 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.32 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.32 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.06 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.39 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.86 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.75 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.74 
 
 
447 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.91 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.01 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.91 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>