170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2756 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  99.24 
 
 		 397 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 397 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  96.73 
 
 		 397 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  93.18 
 
 		 397 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  66.42 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  66.92 
 
 		 407 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  71.32 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  55.24 
 
 		 402 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  55.5 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  53.94 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  52.15 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  52.15 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  53.44 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  53.71 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  53.94 
 
 		 395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  56.18 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  49.37 
 
 		 403 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  49.63 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  50.79 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 404 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  48.06 
 
 		 408 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  51.22 
 
 		 404 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 		 403 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  47.26 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  45.8 
 
 		 405 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  45.8 
 
 		 405 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  47.51 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  46.06 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  47.26 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  46.06 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  47.26 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  48.6 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 419 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  45.16 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  45.43 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 411 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  46.31 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  48.1 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  42.51 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  40.2 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  40.31 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  40.31 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  40.31 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  40.05 
 
 		 392 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  40.77 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  40.91 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  40.91 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  40.91 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  40.91 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  40.66 
 
 		 392 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  40.91 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  40.66 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  38.04 
 
 		 410 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  38.04 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  36.18 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  35.57 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  34.86 
 
 		 398 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 225 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 182 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.93 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.93 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.06 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>