272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2473 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  99.23 
 
 
392 aa  751    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  88.52 
 
 
392 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
392 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  88.52 
 
 
392 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  98.98 
 
 
392 aa  747    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  98.72 
 
 
392 aa  748    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  85.2 
 
 
392 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  98.98 
 
 
392 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  99.23 
 
 
392 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  754    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  88.78 
 
 
392 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  88.27 
 
 
392 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  54.5 
 
 
410 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  49.32 
 
 
388 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  46.77 
 
 
388 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  46.68 
 
 
411 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  49.59 
 
 
393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  43.85 
 
 
402 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  43.83 
 
 
410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  46.63 
 
 
403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  47.31 
 
 
403 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  45.11 
 
 
402 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  43.28 
 
 
395 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  46.67 
 
 
404 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 
410 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  48.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  41.54 
 
 
399 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  47.26 
 
 
408 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  46.15 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  46.15 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  46.15 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  45.89 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  45.89 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  40.16 
 
 
410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  42.89 
 
 
400 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  45.62 
 
 
404 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  40.48 
 
 
407 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  42.27 
 
 
400 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  41.03 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  45.84 
 
 
403 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  44.15 
 
 
395 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  38.73 
 
 
409 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  42.03 
 
 
397 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  39.06 
 
 
395 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  43.09 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  43.68 
 
 
409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  42.86 
 
 
402 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 
397 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  42.82 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  42.2 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  41.94 
 
 
405 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  41.34 
 
 
400 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  43.09 
 
 
405 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  42.47 
 
 
419 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  41.54 
 
 
416 aa  252  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  42.47 
 
 
405 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
416 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  42.47 
 
 
405 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  42.47 
 
 
416 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  42.47 
 
 
419 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  42.47 
 
 
416 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  42.47 
 
 
419 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  41.06 
 
 
399 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  42.19 
 
 
419 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  43.09 
 
 
405 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  39.37 
 
 
398 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  41.09 
 
 
405 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  39.12 
 
 
390 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  40.45 
 
 
225 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  45.91 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
383 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  29.18 
 
 
388 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
391 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
401 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.73 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.4 
 
 
409 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.2 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.94 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.81 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.63 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.54 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.64 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>