128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0727 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  97.03 
 
 		 404 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  88.37 
 
 		 404 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  97.03 
 
 		 404 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  99.75 
 
 		 404 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  97.03 
 
 		 404 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  88.34 
 
 		 407 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  88.09 
 
 		 407 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  93.81 
 
 		 404 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  97.03 
 
 		 404 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 404 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  81.84 
 
 		 403 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  81.14 
 
 		 403 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  79.95 
 
 		 403 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  61.58 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  61.71 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  61.07 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  59.5 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  61.32 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  60.66 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  51.55 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  54.31 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  50.91 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  52.79 
 
 		 411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  50 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 419 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 419 aa  346  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  50.25 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  50.25 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 419 aa  345  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  51.01 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  51.26 
 
 		 400 aa  344  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  50.75 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  50.89 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  50.37 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  50.37 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  50.12 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  52.02 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  49.62 
 
 		 416 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  49.49 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  50.37 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  51.79 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  49.62 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  46.05 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  44.78 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  45.2 
 
 		 392 aa  266  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  44.95 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  44.95 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  44.95 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  39.69 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  40.78 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  39.35 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  38.14 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  35.5 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  36.81 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 182 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 225 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.27 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.77 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.04 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.22 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.16 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  21.93 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>