126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  100 
 
 		 409 aa  778    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  59.84 
 
 		 402 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  57.85 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  59.59 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  56.64 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  56.89 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  55.14 
 
 		 399 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  54.89 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  57.55 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  50 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  59.66 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  48.82 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  49.87 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 404 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  51.76 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  52.19 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  51.98 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  49.74 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  50.79 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  50.79 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  49.87 
 
 		 397 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  48.02 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  48.04 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  47.42 
 
 		 400 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  46.06 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  45.8 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  45.8 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  45.41 
 
 		 409 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 416 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  45.29 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  47.28 
 
 		 405 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  44.22 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  44.18 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  45.8 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  40.7 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  38.23 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  38.23 
 
 		 392 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  38.23 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  38.23 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  38.23 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  38.99 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  38.73 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  38.73 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  38.73 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  38.73 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  38.99 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  38.73 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  37.7 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  37.95 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  34.7 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  37.63 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  35.26 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 182 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 383 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.53 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  19.95 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  20.51 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  20.22 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  20.9 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  20.9 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  20.11 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  20 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  20 
 
 		 381 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.69 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.69 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>