134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0831 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  88.59 
 
 
407 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  88.59 
 
 
407 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  97.77 
 
 
404 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  89.11 
 
 
404 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
404 aa  765    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  97.28 
 
 
404 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
404 aa  765    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  88.59 
 
 
407 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  88.59 
 
 
407 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  88.59 
 
 
407 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  88.83 
 
 
407 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  88.59 
 
 
407 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  94.55 
 
 
404 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
404 aa  765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  97.03 
 
 
404 aa  710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  81.59 
 
 
403 aa  617  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  80.89 
 
 
403 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  79.7 
 
 
403 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  60.75 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  61.07 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  61.96 
 
 
399 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  60.56 
 
 
395 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  60.25 
 
 
402 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 
400 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  61.07 
 
 
395 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  60.41 
 
 
399 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  54.57 
 
 
408 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  51.3 
 
 
410 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  50.65 
 
 
407 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  50.51 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  51.99 
 
 
411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 
419 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  50.76 
 
 
405 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  50.76 
 
 
405 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  50.88 
 
 
416 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 
419 aa  346  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  50.76 
 
 
416 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 
419 aa  345  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 
419 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  51.62 
 
 
405 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 
399 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  50.87 
 
 
405 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 
416 aa  342  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  50.87 
 
 
405 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  51.86 
 
 
395 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  51.02 
 
 
400 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  50.62 
 
 
405 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 
409 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 
416 aa  340  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  51.26 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 
397 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 
397 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 
397 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  50.87 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  51.93 
 
 
405 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  46.32 
 
 
392 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  44.76 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  44.76 
 
 
392 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  44.76 
 
 
392 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  44.76 
 
 
392 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  45.04 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  45.45 
 
 
392 aa  269  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  45.2 
 
 
392 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  45.2 
 
 
392 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
392 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  44.95 
 
 
392 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  44.95 
 
 
392 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  45.2 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  40.2 
 
 
410 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 
410 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  40.78 
 
 
410 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  43.6 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  40.38 
 
 
388 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  39.49 
 
 
398 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  37.34 
 
 
393 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  35.23 
 
 
388 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  31.15 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  40.48 
 
 
182 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  39.66 
 
 
225 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.77 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.27 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.55 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.04 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.17 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  21.93 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.16 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.71 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.31 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.31 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  29.68 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>