164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3953 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  90.37 
 
 		 405 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  90.37 
 
 		 416 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  99.01 
 
 		 405 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  90.37 
 
 		 405 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  89.88 
 
 		 416 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  99.01 
 
 		 405 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  99.51 
 
 		 405 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  99.75 
 
 		 405 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  85.19 
 
 		 409 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  90.12 
 
 		 419 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  90.37 
 
 		 419 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 405 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  90.62 
 
 		 419 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  90.12 
 
 		 416 aa  711    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  90.12 
 
 		 419 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  70.13 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  69.8 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  68.21 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  64.63 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  61.62 
 
 		 411 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  51.51 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  52.01 
 
 		 402 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  52.07 
 
 		 403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 		 404 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  53.48 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  52.48 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  51.98 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  47.96 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  51.62 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  49.34 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  47.45 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  51.99 
 
 		 399 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  52.44 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  48.84 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  47.33 
 
 		 408 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  49.2 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  49.61 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  52.07 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  47.67 
 
 		 395 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  47.85 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  46.3 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  47.24 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  47.83 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  47.49 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  44.76 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  43.55 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  43.55 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  43.28 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  43.09 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  43.55 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  42.47 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  42.2 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  42.2 
 
 		 392 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  42.2 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  42.2 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  41.94 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  41.94 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  39.62 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  35.96 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  34.82 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  35.39 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 182 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 225 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.82 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  26.56 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  26.36 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  26.36 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.42 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.51 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>