138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3885 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 402 aa  773    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  74.37 
 
 		 399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  76.54 
 
 		 405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  73.35 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  66.41 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  66.16 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  66.16 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  66.16 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  66.16 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  66.41 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  66.16 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  66.41 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  65.9 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  65.65 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  64.63 
 
 		 405 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  64.89 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  64.89 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  64.63 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  64.89 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  54.91 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  52.59 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  50.53 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  51.26 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  53.11 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  50.26 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  51.28 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  52.28 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  49.62 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  50.38 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  49.62 
 
 		 404 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  50.51 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  49.11 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  50.64 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  49.33 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  52.55 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  49.73 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  46.43 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  51.52 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  46.61 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  52.33 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  53.06 
 
 		 399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  46.7 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  46.31 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  44.18 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  46.31 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  46.31 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  42.22 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  45.53 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  41.33 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  42.68 
 
 		 392 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  42.43 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  42.43 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  42.43 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  43.29 
 
 		 392 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  43.29 
 
 		 392 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 		 392 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  43.29 
 
 		 392 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  43.04 
 
 		 392 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  43.04 
 
 		 392 aa  248  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  43.67 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  43.18 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 410 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  36.87 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  36.8 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  35.97 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  36.91 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  34.25 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 182 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 225 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  25.76 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  25.76 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  25.76 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  25.48 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.48 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.48 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.25 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.57 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>