187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2209 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
393 aa  742    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  55.71 
 
 
388 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  49.05 
 
 
392 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  49.32 
 
 
392 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  49.05 
 
 
392 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  48.77 
 
 
392 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  48.23 
 
 
392 aa  325  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  49.06 
 
 
410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 
392 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  49.32 
 
 
392 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  49.32 
 
 
392 aa  309  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  49.32 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  49.32 
 
 
392 aa  308  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  49.05 
 
 
392 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  49.05 
 
 
392 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  49.05 
 
 
392 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  44.41 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  38.99 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  40.37 
 
 
402 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 
410 aa  226  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  38.56 
 
 
400 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  41.44 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  39.03 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  38.65 
 
 
403 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
410 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  39.59 
 
 
402 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  38.78 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  34.77 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  37.37 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  37.16 
 
 
411 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  38.48 
 
 
395 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  36.98 
 
 
399 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  34.57 
 
 
407 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  37.41 
 
 
416 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  35.46 
 
 
402 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  37.08 
 
 
397 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  36.11 
 
 
400 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  35.39 
 
 
399 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  35.81 
 
 
397 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  34.96 
 
 
409 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  34.34 
 
 
395 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
404 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
404 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
404 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
404 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  36.84 
 
 
404 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
404 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
397 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  37.26 
 
 
403 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
397 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  36.15 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  34.85 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  34.54 
 
 
405 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 
405 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  38.96 
 
 
399 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  34.82 
 
 
405 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  36.17 
 
 
398 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  34.82 
 
 
405 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  34.82 
 
 
405 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  37.08 
 
 
404 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  33.61 
 
 
405 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
416 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  33.61 
 
 
405 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 
419 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 
419 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 
419 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 
416 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  34.82 
 
 
405 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  34.51 
 
 
390 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  34.4 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
413 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  35.15 
 
 
225 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  40.12 
 
 
182 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.11 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.99 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  26.22 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.09 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.79 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.06 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.79 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.52 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.79 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.52 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.79 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.79 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>