147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3302 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  96.27 
 
 		 402 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 402 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  70.13 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  71.98 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  70.13 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  70.96 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  71.43 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  71.72 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  74.87 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  59.06 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  59.5 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  60.25 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  60.25 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  60.25 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  61.52 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  59.25 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  59.5 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  59.5 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  59.59 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  60.15 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  52.03 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  60 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  51.65 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  53.03 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  54.99 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  55.5 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  55.5 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  55.75 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  54.22 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 411 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  53.44 
 
 		 409 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  51.01 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  51.01 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  50.76 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  50 
 
 		 405 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  50 
 
 		 405 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 419 aa  345  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 419 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 416 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 416 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  51.21 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  50.67 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  51.01 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  50.68 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  46.97 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  43.59 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  44.96 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  43.04 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  42.89 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  44.19 
 
 		 392 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  44.19 
 
 		 392 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  44.19 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  42.89 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  43.93 
 
 		 392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  43.93 
 
 		 392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  42.89 
 
 		 392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  44.19 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  42.64 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  42.35 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  40.38 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  39.59 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  37.76 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  39.34 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 225 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 182 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  29.23 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.83 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.75 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  28.15 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.75 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.57 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>