More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0169 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
411 aa  823    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  47.38 
 
 
402 aa  389  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  48.6 
 
 
398 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  49.49 
 
 
403 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  48.7 
 
 
411 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  46.52 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
397 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  44.81 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 
397 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  42.89 
 
 
410 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  47.89 
 
 
408 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  47.63 
 
 
408 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
408 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  47.63 
 
 
408 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  47.63 
 
 
408 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  47.63 
 
 
408 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  43.43 
 
 
410 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  43.88 
 
 
404 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  47.51 
 
 
409 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
397 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  48.95 
 
 
404 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  48.68 
 
 
404 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  48.68 
 
 
404 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  48.42 
 
 
404 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  48.42 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
403 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  42.64 
 
 
407 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  44.09 
 
 
403 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 
403 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 
403 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  42.96 
 
 
404 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  42.96 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  40.69 
 
 
405 aa  319  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  42.71 
 
 
404 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  41.51 
 
 
404 aa  318  1e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  42.46 
 
 
404 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  42.46 
 
 
404 aa  316  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  42.46 
 
 
404 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  42.46 
 
 
404 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  42.46 
 
 
404 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  42.46 
 
 
404 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
406 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  37.5 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  39.19 
 
 
420 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  37.09 
 
 
431 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  35.43 
 
 
487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 
423 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.5 
 
 
416 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
413 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
413 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  37.24 
 
 
418 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  36.41 
 
 
416 aa  266  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  40.98 
 
 
389 aa  264  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  36.76 
 
 
411 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
410 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
415 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  36.75 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  35.7 
 
 
394 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  30.69 
 
 
401 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  34.04 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  34.2 
 
 
407 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  31.9 
 
 
450 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  27.06 
 
 
418 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  27.06 
 
 
418 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.81 
 
 
395 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00877  multidrug resistance 1 transmembrane protein  25.21 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00243064  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.08 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.11 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  22.52 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.39 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.63 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  22.17 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.96 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  23.71 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.91 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.91 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  22.41 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.03 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  28.1 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.84 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  23.05 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  21.29 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  33.52 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  23.81 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  23.81 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  23.81 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>