22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1185 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1185  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  773    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.224199  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0420  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.620052  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0558  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.76436  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  22.46 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  22.07 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  21.85 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2136  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.29 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0668  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  22.02 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  22.01 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  21.62 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.93 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>