More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6746 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  838    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  80.25 
 
 		 418 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  77.14 
 
 		 420 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  66.59 
 
 		 416 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  52.73 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  53.35 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  50 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 411 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  50.77 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  43.23 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  43.23 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  43.23 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  43.23 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  43.23 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  43.23 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  42.71 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 406 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  38.15 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  38.01 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  37.76 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  37.76 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  37.76 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  37.76 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  37.66 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  38.89 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  38.89 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  38.89 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  38.64 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  38.64 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  36.46 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  37.24 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  37.53 
 
 		 409 aa  245  9e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  36.04 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  35.62 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  34.61 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  36.39 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  33.51 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  33.51 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  34.13 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  28.5 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 450 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  24.46 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  29.18 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  27.62 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.67 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  27.99 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.95 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.46 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>