More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0906 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  100 
 
 		 386 aa  737    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  79.33 
 
 		 393 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  74.79 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  72.35 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  51.04 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  43.92 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 420 aa  318  9e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  43.89 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 394 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  46.75 
 
 		 394 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 376 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 415 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  41.4 
 
 		 397 aa  242  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 392 aa  239  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  43.19 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  41.21 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  41.82 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  39.29 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.56 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  37.53 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  37.53 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  39.45 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  40 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  39.73 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  39.73 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  39.73 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  33.76 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  35.83 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 404 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  44.97 
 
 		 222 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>