126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1461 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  777    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  46.49 
 
 
384 aa  330  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  46.49 
 
 
384 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
399 aa  318  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
398 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  51.45 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  48.03 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  43.27 
 
 
382 aa  299  5e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 
389 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  44.68 
 
 
397 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  39.95 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
379 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  47.41 
 
 
391 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  43.7 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  40.56 
 
 
394 aa  266  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 
388 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
391 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  40.42 
 
 
409 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  43.72 
 
 
398 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  43.27 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  36.79 
 
 
423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  38.11 
 
 
420 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  40.38 
 
 
419 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  35.82 
 
 
415 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  32.28 
 
 
364 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  33.15 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  38.14 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  32.49 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  32.72 
 
 
406 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
403 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  31.11 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
392 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  32.3 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  29.44 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  29.44 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  27.16 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  29.36 
 
 
402 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
405 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  31.39 
 
 
398 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  30.73 
 
 
400 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  30.58 
 
 
402 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
404 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
406 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  31.45 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  30.25 
 
 
399 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  30.52 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  45.12 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  46.01 
 
 
370 aa  119  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.42 
 
 
417 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.75 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  30.45 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  30.73 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  27.82 
 
 
420 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  30.08 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  29.19 
 
 
453 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  30.79 
 
 
407 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  29.25 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  28.72 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  31.68 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  29.94 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  29.46 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  28.45 
 
 
393 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  28.25 
 
 
401 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  27.32 
 
 
387 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  27.65 
 
 
396 aa  107  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  27.97 
 
 
401 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  26.76 
 
 
387 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  30.53 
 
 
404 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  28.13 
 
 
404 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  29.89 
 
 
414 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  28.77 
 
 
402 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  31.01 
 
 
403 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  26.89 
 
 
399 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
393 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
394 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  29.25 
 
 
394 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  28.53 
 
 
376 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
455 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  28.76 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
420 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  29.83 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  30.81 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  29.28 
 
 
404 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  29.4 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  26.44 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  25.06 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  26.98 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  29.7 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  29.7 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>