More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3204 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  100 
 
 
401 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  98.75 
 
 
401 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  76.25 
 
 
403 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  77.08 
 
 
402 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  76.15 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  76.15 
 
 
402 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  76.15 
 
 
402 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  76.15 
 
 
402 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  75.9 
 
 
446 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  75.9 
 
 
446 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  59.14 
 
 
406 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  58.96 
 
 
403 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 
409 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  61.05 
 
 
400 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  59.22 
 
 
403 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  58.44 
 
 
393 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  56.56 
 
 
402 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 
392 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  57.61 
 
 
401 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  59.04 
 
 
404 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  59.74 
 
 
400 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  58.38 
 
 
405 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  57.29 
 
 
402 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  60.21 
 
 
400 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  55.22 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  55.22 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  55.73 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  57.14 
 
 
397 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  55.9 
 
 
398 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  56.65 
 
 
399 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  55.38 
 
 
389 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.85 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  58.22 
 
 
400 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 
394 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  58.13 
 
 
404 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  53.37 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  55.85 
 
 
418 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  57.94 
 
 
407 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  55.35 
 
 
414 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  58.24 
 
 
403 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  55.68 
 
 
404 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  48.56 
 
 
387 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  48.56 
 
 
387 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  54.38 
 
 
403 aa  361  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  47.03 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  37.43 
 
 
404 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  33.76 
 
 
420 aa  229  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
406 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  33.92 
 
 
417 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  40.33 
 
 
386 aa  222  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  39.28 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  33.66 
 
 
420 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  37.29 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
393 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  33.24 
 
 
376 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
385 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  60.84 
 
 
222 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
388 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  33.85 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  34.41 
 
 
411 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  34.52 
 
 
399 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
394 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  35.77 
 
 
394 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  38.42 
 
 
391 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  38.42 
 
 
391 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  37.6 
 
 
388 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  35.93 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  35.71 
 
 
402 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  33.96 
 
 
406 aa  166  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  34.41 
 
 
406 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  33.42 
 
 
422 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  31.05 
 
 
396 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
420 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
434 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
455 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  33.83 
 
 
429 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
412 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  33.12 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  26.36 
 
 
397 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  27.56 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  27.56 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  29.04 
 
 
397 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  31.86 
 
 
423 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.57 
 
 
404 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
395 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
393 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  27.86 
 
 
393 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  26.35 
 
 
382 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  28.1 
 
 
394 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  32.06 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
388 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
398 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
399 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  30.68 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>