163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1461 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  783    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  37.15 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  36.2 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  35.73 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 385 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 392 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  34.34 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  34.25 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  34.04 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  35 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  36.05 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  32.72 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  31.9 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.6 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  33.51 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 402 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  35 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  34.5 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  34.6 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  32.43 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  30.15 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  32.16 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  31.89 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  32.16 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  32.16 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  31.89 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  32.16 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  31.85 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 429 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  40.65 
 
 		 222 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>