More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3382 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 393 aa  768    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  75.7 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  73.06 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  71.51 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  48.47 
 
 		 386 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 417 aa  301  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  46.74 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  46.74 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  40.89 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  40 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  38.36 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  40 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  38.28 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  36.94 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  36.94 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 403 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  38.6 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 403 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.61 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  36.07 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  37 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 402 aa  202  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  37.7 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  36.46 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  37.27 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  37.27 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  37.27 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  37.27 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  37.27 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  37.27 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  36.71 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  32.04 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  45.75 
 
 		 222 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  25 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 393 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 415 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  21.56 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>