127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1554 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
399 aa  779    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  55.24 
 
 
398 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  56.03 
 
 
397 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  53.56 
 
 
384 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  53.56 
 
 
384 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  51.46 
 
 
382 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  55.06 
 
 
393 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  49.5 
 
 
393 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 
389 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  48.01 
 
 
389 aa  319  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  55.95 
 
 
391 aa  319  6e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
391 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 
379 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  42.67 
 
 
394 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  40.85 
 
 
404 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  40.55 
 
 
409 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  41.99 
 
 
409 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  39.39 
 
 
423 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  39.84 
 
 
420 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  39.32 
 
 
398 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  38.12 
 
 
419 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  37.39 
 
 
415 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  32.96 
 
 
364 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  30.25 
 
 
388 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  39.15 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  47.68 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  36.43 
 
 
365 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
403 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  29.43 
 
 
420 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  28.38 
 
 
406 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
403 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  29.3 
 
 
387 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  29.3 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  29.27 
 
 
417 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  27.73 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  30.32 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  29.72 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  29.5 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  29.69 
 
 
386 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  27.2 
 
 
402 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  27.2 
 
 
402 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  28.88 
 
 
420 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  28.69 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  30.66 
 
 
418 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  31.35 
 
 
402 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  30.45 
 
 
399 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  28.13 
 
 
401 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  28.27 
 
 
414 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  28.77 
 
 
453 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.3 
 
 
404 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
392 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  26.85 
 
 
404 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  29.36 
 
 
400 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  29.19 
 
 
393 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  28.69 
 
 
403 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 
400 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
400 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  27.81 
 
 
404 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  26.63 
 
 
376 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
404 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
405 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  28.77 
 
 
415 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  29.48 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  31.01 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  30.45 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  26.49 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  28.49 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  28.24 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  28.84 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  26.82 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  27.49 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  28.11 
 
 
393 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  29.57 
 
 
386 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
386 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  25.14 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  27.41 
 
 
406 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  27.55 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  25.97 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  27.51 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  26.82 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  26.2 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  32.26 
 
 
422 aa  77  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  26.92 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  28.27 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  28.27 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  26.7 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>