More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1388 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  94.79 
 
 		 403 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  82.91 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  77.02 
 
 		 406 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  76.9 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  76.12 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  72.05 
 
 		 404 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  71.65 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  78.19 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  73.58 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  69.74 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  72.98 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  71.43 
 
 		 392 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  75.58 
 
 		 400 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  70.99 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  67.42 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  67.42 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  67.42 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  71.17 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  73.32 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  67.74 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  60.46 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  58.82 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  58.82 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  59.22 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  58.44 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  56.33 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  56.96 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  61.45 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  57.63 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  56.8 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  55.06 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  58.1 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  54.2 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  55.42 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  59.05 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  55.28 
 
 		 446 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  55.28 
 
 		 446 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  55.03 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  55.03 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  55.03 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  55.03 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  37.62 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  36.93 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  66.48 
 
 		 222 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  41.46 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  38.18 
 
 		 386 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  32.11 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  38.64 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  34.24 
 
 		 406 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 429 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  31.1 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>