135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0250 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  780    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 389 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 398 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 382 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  50.57 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 388 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  40.69 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  43.44 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  41.76 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 415 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  30.49 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  29.73 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  27.54 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  27.06 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.92 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  30.53 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  29.92 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  25.41 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  25.14 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  27.16 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  34.04 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  35 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  25 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  26.12 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  28.92 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0310  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>