More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6190 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  76.01 
 
 
404 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  74.67 
 
 
403 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  74.87 
 
 
406 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  77.37 
 
 
394 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  71.65 
 
 
403 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  72.37 
 
 
400 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  70.29 
 
 
400 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  67.18 
 
 
402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  70.29 
 
 
400 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  67.26 
 
 
402 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  66.5 
 
 
402 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  66.5 
 
 
402 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  67.34 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  67.99 
 
 
392 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  68.22 
 
 
404 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  67.96 
 
 
405 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  70.05 
 
 
404 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  66.75 
 
 
397 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  68.22 
 
 
400 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  68.65 
 
 
393 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  60.48 
 
 
387 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  60.21 
 
 
387 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  59.89 
 
 
409 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  57.14 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  55.9 
 
 
401 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  56.36 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  55.53 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  57.5 
 
 
414 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  55.76 
 
 
399 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  60.34 
 
 
407 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  55.97 
 
 
418 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  60.16 
 
 
404 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  58.45 
 
 
403 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  51.08 
 
 
401 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  56.92 
 
 
403 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  57.82 
 
 
403 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  56.25 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  56.25 
 
 
446 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  56.25 
 
 
446 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  56.25 
 
 
402 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  56.25 
 
 
402 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  56.25 
 
 
402 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  56.25 
 
 
402 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  46.83 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  36.36 
 
 
420 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  67.25 
 
 
222 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  36.83 
 
 
417 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  41.74 
 
 
393 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  37.37 
 
 
420 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  37.13 
 
 
376 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  41.69 
 
 
386 aa  226  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 
406 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  37.95 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  40.85 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  37.57 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
394 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  35.62 
 
 
394 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  37.9 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 
386 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 
385 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  34.93 
 
 
411 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  36.75 
 
 
415 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  35.71 
 
 
406 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  33.06 
 
 
396 aa  176  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  32.87 
 
 
422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  34.71 
 
 
406 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  33.61 
 
 
402 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  37.04 
 
 
391 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  37.04 
 
 
391 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  37.32 
 
 
388 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
420 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
434 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  33.95 
 
 
426 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  31.28 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  29.21 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
398 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  30.11 
 
 
384 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  30.11 
 
 
384 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
412 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
395 aa  123  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  24.66 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  32.27 
 
 
389 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
389 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  31.39 
 
 
397 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
399 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  28.45 
 
 
393 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  28.13 
 
 
382 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  30.58 
 
 
423 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
388 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
393 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  27.42 
 
 
394 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  31.46 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  33.44 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>