115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3105 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  766    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  32.15 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 419 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 415 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  32.08 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 414 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  26.87 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  24.29 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  28.9 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  26.26 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  25.99 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  25.21 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  26.58 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  25.63 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  23.58 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  31.17 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1162  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  27.81 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2108  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  24.34 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  27.01 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  25.46 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  25.46 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>