128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1922 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  100 
 
 
422 aa  806    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  56.28 
 
 
406 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
420 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 
420 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  41.47 
 
 
429 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 
434 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  32.51 
 
 
376 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  35.99 
 
 
386 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  33.7 
 
 
402 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  33.7 
 
 
402 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  33.7 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
403 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  35.06 
 
 
399 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  34.95 
 
 
401 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  36.16 
 
 
393 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  34.68 
 
 
400 aa  170  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  32.85 
 
 
406 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  33.06 
 
 
401 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  32.6 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  32.51 
 
 
387 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  34.16 
 
 
398 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  38.54 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  33.8 
 
 
402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.88 
 
 
404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  36.29 
 
 
388 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  33.33 
 
 
402 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  36.11 
 
 
400 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
400 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  32.98 
 
 
393 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  34.05 
 
 
418 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  34.32 
 
 
389 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
405 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
404 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  32.02 
 
 
453 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  34.7 
 
 
386 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  30.95 
 
 
417 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
409 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  32.6 
 
 
404 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  35.07 
 
 
400 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  32.49 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  30.65 
 
 
420 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  31.58 
 
 
401 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  32.64 
 
 
406 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  34.25 
 
 
403 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  32.89 
 
 
414 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  32.41 
 
 
404 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  31.55 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  31.64 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  31.74 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  30.75 
 
 
420 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
394 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
393 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  32.02 
 
 
411 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  27.85 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  35.08 
 
 
391 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  35.08 
 
 
391 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  34.24 
 
 
388 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  43.51 
 
 
222 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
394 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  30.13 
 
 
394 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  29.95 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  25.19 
 
 
397 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  32.91 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  32.91 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  33.42 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  33.42 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  32.97 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  31.55 
 
 
415 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  31.82 
 
 
403 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 
426 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.41 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  30.88 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  40.65 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  30.73 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  30.73 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  29.64 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  39.46 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  33.94 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  36.21 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  37.24 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.533626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>