More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5351 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 		 404 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  76.01 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  73.39 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  73.25 
 
 		 406 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  72.05 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  71.73 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  78.23 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  69.19 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  68.46 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  68.46 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  68.21 
 
 		 402 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  70.5 
 
 		 402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  68.48 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  69.55 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  69.95 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  68.59 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  69.85 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  68.38 
 
 		 404 aa  501  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  67.8 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  67.01 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  68.98 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  59.34 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  58.02 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  59.38 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  57.75 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  56.67 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  57.56 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  56.87 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  59.22 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  56.84 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  58.58 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  55.79 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  53.79 
 
 		 403 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  54.59 
 
 		 402 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  56.32 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  56.32 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  56.32 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  56.32 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  56.32 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  67.84 
 
 		 222 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  34.71 
 
 		 417 aa  225  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  40 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  35.61 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 406 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  37.08 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  33.94 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  34.53 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  31.68 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 393 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  39 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>