135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1549 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  60 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  59.17 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  54.49 
 
 		 415 aa  299  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  48.58 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 409 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  47.36 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 397 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  34.51 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.16 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  32.67 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  27.82 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  27.55 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  29.92 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  27.45 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  28.53 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  36.42 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  32.66 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  33.12 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  28.61 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  28.61 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>